MSProjectを使うほどじゃない規模でも
ウェブサイト構築と運営であれば
ドキュメントの作成と共有にwiki
PukiWiki http://www.thinkit.co.jp/free/article/0609/5/6/
問題課題管理にバグ管理ツール
Mantis http://www.alles.or.jp/~sogabe/mantis/
Subversionでバージョン管理
http://www.gside.org/Gentoo/subversion/subversion_client.html
あとメールはMLやエイリアスだけでなく掲示板付でアーカイブされると便利だし、
スケジュールとWBSの共有もあるともちろんもっと便利です。